Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms