Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trp53i11Q4QQM4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trp53i11Q4QQM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms