Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim26Q3V460 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms