Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc114Q3UX62 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc114Q3UX62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms