Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28047Q3US59 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms