Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cln5Q3UMW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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