Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zswim8Q3UHH1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zswim8Q3UHH1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms