Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbrg1Q3UB74 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbrg1Q3UB74 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbrg1Q3UB74 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbrg1Q3UB74 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms