Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trip13Q3UA06 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms