Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cops9Q3U898 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms