Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms