Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Hbq1bQ3U0A6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hbq1bQ3U0A6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Hbq1bQ3U0A6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms