Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700066B19RikQ3TS39 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700066B19RikQ3TS39 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms