Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms