Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms