Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap5b1Q3TAP4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms