Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq3Q14DL3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrriq3Q14DL3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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