Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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