Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtel1Q0VGM9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtel1Q0VGM9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtel1Q0VGM9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtel1Q0VGM9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtel1Q0VGM9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtel1Q0VGM9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms