Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms