Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F13bQ07968 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms