Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms