Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf3Q07104 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms