Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms