Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms