Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a1Q04857 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col6a1Q04857 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms