Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms