Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brca2P97929 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms