Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crmp1P97427 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crmp1P97427 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crmp1P97427 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crmp1P97427 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crmp1P97427 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms