Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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