Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpcaP84075 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms