Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf6P70279 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf6P70279 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms