Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CalcaP70160 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CalcaP70160 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms