Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UbdP63072 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UbdP63072 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UbdP63072 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UbdP63072 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UbdP63072 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms