Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnnP61807 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnnP61807 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnnP61807 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnnP61807 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnnP61807 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnnP61807 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnnP61807 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnnP61807 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms