Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arf3P61205 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf3P61205 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf3P61205 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms