Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b6P59708 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms