Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P58686 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P58686 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P58686 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P58686 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P58686 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
P58686 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P58686 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P58686 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms