Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp1P58466 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp1P58466 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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