Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strn4P58404 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Strn4P58404 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Strn4P58404 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms