Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lad1P57016 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lad1P57016 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms