Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd5P56812 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms