Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp1P56183 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms