Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpbP50405 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms