Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tacr3P47937 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tacr3P47937 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms