Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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