Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chd1P40201 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd1P40201 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd1P40201 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms