Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab12P35283 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab12P35283 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms