Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms