Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms